Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arf1P84078 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arf1P84078 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arf1P84078 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Arf1P84078 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Arf1P84078 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms