Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx1P80205 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx1P80205 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx1P80205 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx1P80205 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx1P80205 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms