Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldb1P70662 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldb1P70662 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldb1P70662 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldb1P70662 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldb1P70662 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldb1P70662 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldb1P70662 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldb1P70662 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldb1P70662 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldb1P70662 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldb1P70662 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldb1P70662 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldb1P70662 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldb1P70662 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldb1P70662 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldb1P70662 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldb1P70662 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldb1P70662 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldb1P70662 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldb1P70662 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldb1P70662 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldb1P70662 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldb1P70662 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldb1P70662 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldb1P70662 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldb1P70662 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldb1P70662 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldb1P70662 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldb1P70662 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldb1P70662 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldb1P70662 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms