Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad50P70388 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad50P70388 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad50P70388 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad50P70388 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad50P70388 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad50P70388 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad50P70388 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rad50P70388 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad50P70388 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad50P70388 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad50P70388 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad50P70388 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad50P70388 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad50P70388 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad50P70388 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad50P70388 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad50P70388 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad50P70388 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad50P70388 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad50P70388 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad50P70388 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad50P70388 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad50P70388 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad50P70388 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad50P70388 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad50P70388 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad50P70388 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad50P70388 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad50P70388 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms