Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SbdsP70122 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SbdsP70122 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SbdsP70122 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SbdsP70122 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SbdsP70122 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SbdsP70122 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SbdsP70122 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SbdsP70122 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SbdsP70122 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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