Protein–RNA interactions for Protein: P63024

Vamp3, Vesicle-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp3P63024 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms