Protein–RNA interactions for Protein: P62892

Rpl39, 60S ribosomal protein L39, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39P62892 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpl39P62892 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpl39P62892 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC9.4□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms