Protein–RNA interactions for Protein: P62838

Ube2d2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d2P62838 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ube2d2P62838 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ube2d2P62838 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Ube2d2P62838 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Ube2d2P62838 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms