Protein–RNA interactions for Protein: P62830

Rpl23, 60S ribosomal protein L23, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23P62830 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl23P62830 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms