Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms