Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rps29P62274 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rps29P62274 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rps29P62274 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rps29P62274 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps29P62274 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps29P62274 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps29P62274 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms