Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp46P62069 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp46P62069 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp46P62069 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp46P62069 4930589L23Rik-201ENSMUST00000091023 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp46P62069 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp46P62069 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp46P62069 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp46P62069 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms