Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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