Protein–RNA interactions for Protein: P61089

Ube2n, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2nP61089 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms