Protein–RNA interactions for Protein: P61079

Ube2d3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d3P61079 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
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Ube2d3P61079 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
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Ube2d3P61079 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
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