Protein–RNA interactions for Protein: P61014

Pln, Cardiac phospholamban, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlnP61014 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PlnP61014 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PlnP61014 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PlnP61014 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PlnP61014 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PlnP61014 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PlnP61014 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PlnP61014 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PlnP61014 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PlnP61014 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PlnP61014 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PlnP61014 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PlnP61014 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PlnP61014 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
PlnP61014 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
PlnP61014 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PlnP61014 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PlnP61014 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
PlnP61014 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
PlnP61014 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
PlnP61014 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PlnP61014 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PlnP61014 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PlnP61014 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PlnP61014 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PlnP61014 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PlnP61014 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
PlnP61014 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PlnP61014 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PlnP61014 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PlnP61014 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PlnP61014 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PlnP61014 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PlnP61014 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PlnP61014 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PlnP61014 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PlnP61014 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PlnP61014 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
PlnP61014 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PlnP61014 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PlnP61014 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PlnP61014 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PlnP61014 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PlnP61014 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PlnP61014 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PlnP61014 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PlnP61014 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PlnP61014 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PlnP61014 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PlnP61014 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PlnP61014 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PlnP61014 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PlnP61014 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PlnP61014 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PlnP61014 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PlnP61014 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PlnP61014 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PlnP61014 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PlnP61014 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PlnP61014 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PlnP61014 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PlnP61014 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PlnP61014 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PlnP61014 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PlnP61014 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PlnP61014 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PlnP61014 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PlnP61014 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PlnP61014 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PlnP61014 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PlnP61014 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PlnP61014 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PlnP61014 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PlnP61014 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PlnP61014 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PlnP61014 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PlnP61014 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PlnP61014 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PlnP61014 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PlnP61014 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PlnP61014 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PlnP61014 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PlnP61014 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PlnP61014 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PlnP61014 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PlnP61014 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PlnP61014 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PlnP61014 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PlnP61014 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PlnP61014 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PlnP61014 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PlnP61014 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PlnP61014 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PlnP61014 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PlnP61014 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PlnP61014 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PlnP61014 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PlnP61014 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PlnP61014 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PlnP61014 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms