Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms