Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P58686 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P58686 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P58686 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P58686 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
P58686 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P58686 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P58686 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P58686 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
P58686 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P58686 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P58686 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
P58686 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P58686 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P58686 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P58686 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P58686 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P58686 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P58686 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P58686 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P58686 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P58686 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P58686 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P58686 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P58686 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P58686 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P58686 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P58686 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P58686 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P58686 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P58686 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P58686 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P58686 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P58686 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
P58686 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P58686 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
P58686 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
P58686 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
P58686 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
P58686 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P58686 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P58686 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P58686 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P58686 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P58686 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P58686 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P58686 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P58686 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P58686 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P58686 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P58686 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P58686 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P58686 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P58686 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P58686 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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P58686 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P58686 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P58686 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P58686 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
P58686 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
P58686 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
P58686 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P58686 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P58686 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P58686 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P58686 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P58686 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P58686 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P58686 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P58686 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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P58686 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P58686 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P58686 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P58686 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P58686 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P58686 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P58686 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P58686 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P58686 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P58686 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P58686 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
P58686 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P58686 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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P58686 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P58686 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P58686 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
P58686 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
P58686 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
P58686 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P58686 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P58686 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P58686 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P58686 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P58686 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P58686 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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