Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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