Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp5P56399 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp5P56399 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp5P56399 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp5P56399 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp5P56399 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp5P56399 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp5P56399 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp5P56399 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp5P56399 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms