Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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