Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms