Protein–RNA interactions for Protein: P46735

Myo1b, Unconventional myosin-Ib, mousemouse

Predictions only

Length 1,107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo1bP46735 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Myo1bP46735 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Myo1bP46735 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Myo1bP46735 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Myo1bP46735 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Myo1bP46735 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Myo1bP46735 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Myo1bP46735 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Myo1bP46735 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Myo1bP46735 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Myo1bP46735 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Myo1bP46735 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Myo1bP46735 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Myo1bP46735 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Myo1bP46735 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Myo1bP46735 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Myo1bP46735 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Myo1bP46735 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Myo1bP46735 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Myo1bP46735 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Myo1bP46735 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Myo1bP46735 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Myo1bP46735 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Myo1bP46735 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Myo1bP46735 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms