Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms