Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Tnfsf9P41274 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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