Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms