Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms