Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Traf1P39428 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf1P39428 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf1P39428 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf1P39428 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf1P39428 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf1P39428 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf1P39428 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf1P39428 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf1P39428 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf1P39428 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf1P39428 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms