Protein–RNA interactions for Protein: P38060

Hmgcl, Hydroxymethylglutaryl-CoA lyase, mitochondrial, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgclP38060 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HmgclP38060 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HmgclP38060 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HmgclP38060 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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HmgclP38060 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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HmgclP38060 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HmgclP38060 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms