Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Lig1P37913 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Lig1P37913 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lig1P37913 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Lig1P37913 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lig1P37913 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Lig1P37913 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lig1P37913 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Lig1P37913 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Lig1P37913 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lig1P37913 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Lig1P37913 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Lig1P37913 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Lig1P37913 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lig1P37913 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lig1P37913 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Lig1P37913 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lig1P37913 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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