Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rom1P32958 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rom1P32958 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rom1P32958 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rom1P32958 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rom1P32958 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rom1P32958 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rom1P32958 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rom1P32958 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rom1P32958 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rom1P32958 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rom1P32958 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rom1P32958 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rom1P32958 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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