Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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