Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

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Length 674 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms