Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprmP28828 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprmP28828 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprmP28828 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprmP28828 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PtprmP28828 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprmP28828 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprmP28828 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprmP28828 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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