Protein–RNA interactions for Protein: P28660

Nckap1, Nck-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap1P28660 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nckap1P28660 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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