Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa2P28309 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa2P28309 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa2P28309 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa2P28309 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms