Protein–RNA interactions for Protein: P27090

Tgfb2, Transforming growth factor beta-2, mousemouse

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Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb2P27090 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfb2P27090 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfb2P27090 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfb2P27090 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfb2P27090 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfb2P27090 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfb2P27090 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfb2P27090 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfb2P27090 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfb2P27090 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfb2P27090 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfb2P27090 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfb2P27090 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfb2P27090 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfb2P27090 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfb2P27090 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfb2P27090 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfb2P27090 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfb2P27090 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfb2P27090 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfb2P27090 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfb2P27090 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfb2P27090 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfb2P27090 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfb2P27090 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfb2P27090 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfb2P27090 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfb2P27090 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfb2P27090 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfb2P27090 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfb2P27090 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfb2P27090 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfb2P27090 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfb2P27090 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfb2P27090 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfb2P27090 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfb2P27090 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfb2P27090 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tgfb2P27090 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tgfb2P27090 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tgfb2P27090 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tgfb2P27090 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tgfb2P27090 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tgfb2P27090 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms