Protein–RNA interactions for Protein: P23708

Nfya, Nuclear transcription factor Y subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfyaP23708 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC11□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC11□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC11□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC11□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NfyaP23708 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NfyaP23708 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NfyaP23708 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NfyaP23708 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms