Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PparaP23204 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PparaP23204 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PparaP23204 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PparaP23204 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PparaP23204 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PparaP23204 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PparaP23204 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PparaP23204 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PparaP23204 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PparaP23204 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PparaP23204 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PparaP23204 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PparaP23204 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PparaP23204 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PparaP23204 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PparaP23204 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PparaP23204 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PparaP23204 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PparaP23204 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PparaP23204 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PparaP23204 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PparaP23204 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PparaP23204 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PparaP23204 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PparaP23204 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PparaP23204 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PparaP23204 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PparaP23204 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PparaP23204 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PparaP23204 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PparaP23204 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PparaP23204 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PparaP23204 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PparaP23204 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PparaP23204 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PparaP23204 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PparaP23204 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PparaP23204 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PparaP23204 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PparaP23204 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PparaP23204 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PparaP23204 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PparaP23204 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PparaP23204 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PparaP23204 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PparaP23204 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PparaP23204 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PparaP23204 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PparaP23204 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PparaP23204 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PparaP23204 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PparaP23204 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PparaP23204 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PparaP23204 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PparaP23204 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PparaP23204 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PparaP23204 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PparaP23204 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PparaP23204 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PparaP23204 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PparaP23204 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PparaP23204 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PparaP23204 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PparaP23204 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PparaP23204 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PparaP23204 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PparaP23204 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PparaP23204 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PparaP23204 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PparaP23204 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PparaP23204 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PparaP23204 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PparaP23204 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PparaP23204 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PparaP23204 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PparaP23204 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PparaP23204 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PparaP23204 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PparaP23204 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PparaP23204 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PparaP23204 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PparaP23204 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PparaP23204 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PparaP23204 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PparaP23204 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PparaP23204 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PparaP23204 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PparaP23204 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PparaP23204 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PparaP23204 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PparaP23204 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PparaP23204 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PparaP23204 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PparaP23204 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PparaP23204 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PparaP23204 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PparaP23204 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PparaP23204 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PparaP23204 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms