Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms