Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P20040 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
P20040 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P20040 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P20040 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P20040 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
P20040 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
P20040 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
P20040 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
P20040 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
P20040 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
P20040 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
P20040 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P20040 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
P20040 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P20040 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
P20040 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P20040 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P20040 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P20040 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P20040 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
P20040 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P20040 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
P20040 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P20040 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P20040 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P20040 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P20040 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P20040 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P20040 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P20040 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
P20040 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
P20040 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P20040 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P20040 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P20040 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P20040 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
P20040 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
P20040 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
P20040 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
P20040 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P20040 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
P20040 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P20040 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P20040 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
P20040 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P20040 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
P20040 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
P20040 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P20040 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P20040 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
P20040 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
P20040 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
P20040 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P20040 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P20040 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P20040 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P20040 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P20040 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P20040 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P20040 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P20040 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P20040 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P20040 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
P20040 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
P20040 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
P20040 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
P20040 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
P20040 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
P20040 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
P20040 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
P20040 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
P20040 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
P20040 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
P20040 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
P20040 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
P20040 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
P20040 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
P20040 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
P20040 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
P20040 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
P20040 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
P20040 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
P20040 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
P20040 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
P20040 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
P20040 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
P20040 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
P20040 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
P20040 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
P20040 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
P20040 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
P20040 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
P20040 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
P20040 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
P20040 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
P20040 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
P20040 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
P20040 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
P20040 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms