Protein–RNA interactions for Protein: P18526

Ig heavy chain V region 345, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18526 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18526 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
P18526 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18526 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18526 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18526 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18526 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18526 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18526 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18526 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18526 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18526 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18526 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18526 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18526 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18526 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18526 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18526 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18526 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18526 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18526 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18526 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18526 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18526 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18526 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18526 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18526 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18526 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P18526 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18526 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18526 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P18526 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18526 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18526 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18526 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P18526 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18526 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18526 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18526 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18526 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18526 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18526 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18526 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18526 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18526 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18526 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18526 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18526 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18526 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18526 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18526 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
P18526 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
P18526 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
P18526 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
P18526 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18526 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18526 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18526 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18526 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18526 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18526 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
P18526 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18526 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18526 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18526 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18526 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18526 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18526 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18526 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18526 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18526 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
P18526 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18526 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
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P18526 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18526 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18526 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
P18526 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
P18526 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18526 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18526 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18526 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18526 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18526 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18526 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18526 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18526 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18526 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18526 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18526 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18526 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18526 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18526 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18526 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18526 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18526 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18526 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18526 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18526 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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