Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata1P17679 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata1P17679 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata1P17679 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata1P17679 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gata1P17679 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms