Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Pou4f1P17208 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Pou4f1P17208 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Pou4f1P17208 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Pou4f1P17208 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Pou4f1P17208 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Pou4f1P17208 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Pou4f1P17208 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Pou4f1P17208 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Pou4f1P17208 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Pou4f1P17208 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Pou4f1P17208 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Pou4f1P17208 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms