Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PolP10400 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PolP10400 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PolP10400 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PolP10400 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PolP10400 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PolP10400 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PolP10400 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PolP10400 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PolP10400 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PolP10400 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PolP10400 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PolP10400 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PolP10400 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PolP10400 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PolP10400 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PolP10400 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PolP10400 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PolP10400 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PolP10400 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PolP10400 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PolP10400 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PolP10400 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PolP10400 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PolP10400 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PolP10400 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PolP10400 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PolP10400 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PolP10400 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PolP10400 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PolP10400 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PolP10400 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
PolP10400 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PolP10400 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PolP10400 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PolP10400 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PolP10400 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PolP10400 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PolP10400 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
PolP10400 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
PolP10400 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PolP10400 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PolP10400 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PolP10400 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
PolP10400 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PolP10400 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PolP10400 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PolP10400 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PolP10400 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PolP10400 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PolP10400 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PolP10400 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PolP10400 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PolP10400 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PolP10400 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PolP10400 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PolP10400 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PolP10400 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PolP10400 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PolP10400 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PolP10400 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PolP10400 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PolP10400 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PolP10400 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PolP10400 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PolP10400 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PolP10400 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PolP10400 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PolP10400 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PolP10400 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PolP10400 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PolP10400 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PolP10400 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PolP10400 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PolP10400 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PolP10400 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PolP10400 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PolP10400 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PolP10400 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PolP10400 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PolP10400 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PolP10400 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PolP10400 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PolP10400 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PolP10400 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PolP10400 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PolP10400 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PolP10400 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PolP10400 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PolP10400 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PolP10400 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PolP10400 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PolP10400 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PolP10400 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PolP10400 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PolP10400 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PolP10400 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PolP10400 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PolP10400 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PolP10400 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.7 ms