Protein–RNA interactions for Protein: P0C1Z5

Putative UPF0730 protein encoded by LINC00643 homolog, mousemouse

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Length 52 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P0C1Z5 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P0C1Z5 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P0C1Z5 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P0C1Z5 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P0C1Z5 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P0C1Z5 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P0C1Z5 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P0C1Z5 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P0C1Z5 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P0C1Z5 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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