Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Spta1P08032 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Spta1P08032 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Spta1P08032 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Spta1P08032 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Spta1P08032 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Spta1P08032 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Spta1P08032 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Spta1P08032 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Spta1P08032 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms