Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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