Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P04212 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P04212 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P04212 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P04212 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P04212 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P04212 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P04212 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P04212 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P04212 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P04212 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P04212 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P04212 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P04212 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P04212 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P04212 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P04212 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P04212 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P04212 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P04212 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P04212 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P04212 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P04212 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P04212 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P04212 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P04212 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P04212 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P04212 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P04212 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P04212 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P04212 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P04212 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P04212 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P04212 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P04212 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P04212 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P04212 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P04212 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P04212 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P04212 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P04212 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P04212 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P04212 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P04212 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P04212 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P04212 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P04212 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P04212 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P04212 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P04212 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P04212 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P04212 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P04212 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P04212 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P04212 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P04212 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P04212 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P04212 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P04212 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P04212 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P04212 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P04212 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P04212 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P04212 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P04212 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P04212 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P04212 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P04212 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P04212 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P04212 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P04212 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P04212 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P04212 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P04212 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P04212 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P04212 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P04212 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P04212 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P04212 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P04212 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P04212 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P04212 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P04212 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P04212 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P04212 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P04212 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P04212 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P04212 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P04212 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P04212 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P04212 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P04212 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P04212 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P04212 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P04212 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P04212 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P04212 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P04212 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P04212 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P04212 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
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