Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
AurkcO88445 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
AurkcO88445 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
AurkcO88445 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
AurkcO88445 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
AurkcO88445 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
AurkcO88445 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
AurkcO88445 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
AurkcO88445 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
AurkcO88445 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
AurkcO88445 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
AurkcO88445 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
AurkcO88445 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
AurkcO88445 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
AurkcO88445 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
AurkcO88445 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
AurkcO88445 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
AurkcO88445 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
AurkcO88445 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
AurkcO88445 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
AurkcO88445 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
AurkcO88445 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
AurkcO88445 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
AurkcO88445 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
AurkcO88445 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
AurkcO88445 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
AurkcO88445 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
AurkcO88445 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
AurkcO88445 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
AurkcO88445 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms